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ChIP-seq(Chromatin Immunoprecipitation and high-throughput Sequencing,染色質免疫共沉淀測序)是將染色質免疫共沉淀和高通量測序相結合,通過組蛋白的特異性抗體,將帶有特定修飾的組蛋白-DNA復合物沉淀下來,從而獲取該組蛋白結合的DNA。通過DNA高通量測序和分析,獲得該組蛋白在染色體上的分布情況,并鑒定與該組蛋白有相互作用的DNA片段信息。
技術流程:
我們可為您提供組蛋白ChIP-seq(蛋白-DNA互作研究)技術服務,歡迎咨詢!
需提供材料 | 交付結果 |
細胞:細胞數量>2*106 新鮮/凍存組織:動物組織500mg,植物組織1g | 實驗過程圖 高通量測序數據 生物信息學分析結果 |
更多技術服務:
DNA親和純化測序(DAP-seq)
在全基因組水平上鑒定轉錄因子的結合位點,預測轉錄因子潛在的靶基因。
DAP-seq 技術的出現,使轉錄因子結合位點的研究不再局限于生物物種,不再受抗體質量的限制,進一步拓展并加深了生命科學領域研究的廣度和深度。
DAP-seq與RNA-seq聯合分析
分析轉錄因子的靶基因在RNA-seq數據中的表達變化,深入挖掘DAP-seq和RNA-seq測序數據,增加轉錄組測序的分析深度。
凝膠阻滯或電泳遷移率實驗 (EMSA)
鑒定或驗證 DNA 結合蛋白和 DNA 序列的相互作用。
酵母單雜交技術 (Yeast One-Hybrid)
確定已知 DNA 和蛋白質之間是否存在相互作用。
篩選結合于目標順式作用元件或其他短 DNA 序列的新蛋白。
鑒定蛋白結合 DNA 的結構域,精準定位與DNA 結合的蛋白序列。
DNA pull down
鑒定與DNA序列結合的蛋白質,該技術可用于篩選調控某基因啟動子區域的潛在轉錄因子。
Halo pull down
檢測已知蛋白質之間的相互作用,鑒定與已知蛋白相互作用的未知蛋白。
重組蛋白表達
有大腸桿菌、酵母、昆蟲細胞、哺乳動物細胞4種蛋白表達系統可供選擇。
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